那么到了现在，到了蛋白质晶体结构分析中用直接法有三个工作：一是在蛋白质里面找到重原子，就是找蛋白质的重原子；二是用在高分辨率的衍射数据，从头测定蛋白质晶体结构。第一跟第二是相通的，能够做这个事情程序有三个，这是美国人编的，这是德国人编的，这是英国人编的，没有我们。这个数据只占蛋白质数据里面的5%左右。那么也就是说绝大部分的数据达不到这个要求。

第三，就是把直接法和传统的蛋白质结构分析方法结合起来，结合起来可以提高它的效率，解决一些它本来固有的但是它自己解决不了的问题。它的适用范围可以说包含所有蛋白质库里面的一些蛋白质数据，都有可能清楚。那么做这方面工作，只有一个程序，那就是我们的程序。

下面这个就看我们几个程序版本发展的情况，一个就是OASIS—2000，能够做的是同样三个蛋白，三个不同的蛋白，OASIS—2000是做不全的，只能这样。到2004年的版本就可以做全了，这个可以做全了，第二个版本不行，第三个版本就行，有这么一个改进。第三个版本增加了一个功能，就是不用衍射了，就是把MR的分子切换体，弄出来误差比较大，很难再扩展。那么我们的程序可以从这么一小部分，这是最后的结果。那么我们的程序可以从经过一轮一轮把这个做出来，就是第一轮、第二轮、第三轮到第十轮，跟它基本上是一样的。就是这个功能到现在为止，只有我们这个程序具备这种功能，这是第三个版本。

那么国外有一条线，把我们的程序拉进去了。他原来是黄框黑线。那么把我们的程序搞进去以后，这个红线出来结果要是不理想，就可以推到我们上面去然后再做回来。但是我们这个程序在那里是寄人篱下，出来不满意又找我，所以我们使用效果在那个线里面是很低的，只能找一些特殊的例子。下一步我们自己搞了这样的流水线，就把我们摆在这里了。

为什么要搞这个东西呢？一个单个程序自动化，整个分析过程要用自动化形不成生产力，现在结构生产力里面需要的东西是高效的、自动化的流水线，你能够做出来结构，我们的工作正好可以为这个做一点贡献。我们现在2009年就是我们第四版，这是最新的一版，已经跟别的程序连成一条可以使过程自动化的这么一条线，这是我们现在的东西。其他程序没有我们这个圈里面的东西，那么这是我们的特点。那么在这个特点下面可以扩充成一条比较象样的自动化流水线，就是生物大分子晶体结构解析自动化的流水线，保留了原有的特点增加了新的功能。

它的特点我们在一个项目的计划书里面，我们把这个特点写进去了。第一是以OASIS程序为衍射相位推演核心。我们敢这样写，就是我们这样写我们有我们自己的特点，而这些特点是带有优势的特点，不是缺点方面的特点。那么在这个基础上面，我们要下那国际上各类有关的优秀软件。它的功能应该涵盖当今主要的蛋白质晶体结构解释方法。这是我们在一个样本书里面写的东西，那么不管这个生存下来还是生存不下来，我们都要做，而且我们相信我们这个团队能够把这个事情做好并完成。